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graphvizでpdfを作るとillustrator CS2でフォントが認識されなかったので、フォントを変える方法を探した。次情報元はこちら。http://tug.org/pipermail/texhax/2011-May/017508.html

% dot -Tps hoge.dot > hoge.eps
% epstopdf --noembed hoge.eps

でうまくいった。でも、図が大きすぎてillustratorで編集できない。